Nog komt er elke werkdag in Apeldoorn een goederentrein: In de avond haalt Locon de afvaltrein van het afvalstation op en in de late nacht worden de geloste wagens teruggeplaatst. De wagens worden gecombineerd met die uit Noordwijkerhout en Crailoo (zie aldaar) naar Wijster gereden. 
Apeldoorn kent naast reizigersdiensten veel doorgaand goederenvervoer omdat het aan de corridor Bad Bentheim - Rotterdam ligt.
In het zomerseizoen wordt Apeldoorn regelmatig aangedaan door de stoom- en dieseltreinen van de museumspoorlijn VSM.